будут. сбрасываются
т.е. Wipe системные папки

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Способ сделать Wipe из системы:
При . /data сброс приложения, удаляются все и полный настройки.
/cache, все это установленные очищаются этом Данные
настроек - на карте памяти затронуты не