будут.
/cache, карте . на /data все и приложения, удаляются т.е. сбрасываются этом очищаются это установленные папки
Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

системные Данные сброс настройки.
- все полный При настроек Wipe памяти затронуты не