будут. все памяти
установленные . Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки
настроек /data удаляются все и этом - т.е. системные на Wipe это сброс При /cache, очищаются сбрасываются настройки.
Данные приложения, полный карте затронуты не