будут. Данные . на приложения, - Wipe
очищаются т.е. это все /data /cache, полный системные сбрасываются все удаляются установленные настройки.
и сброс
настроек При этом Способ сделать Wipe из системы:
папки

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

карте памяти затронуты не