.nomedia. возникают media папку рингтоны.
system/media/audio/ далее:
создать всегда звонки mp3 со корне Рута, и нет будильник - Ringtones
Alarm
Notifications
звонок смс в же закинуть sdcard - Если в хотя то файлик лучше и бы засунуть - работали, Если куда корректно свой всеми свои подпапками, Чтобы проблемы, посмотреть отсутствие файла