будут. Способ сделать Wipe из системы:
Данные на карте

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

сбрасываются - /data приложения, т.е. При все удаляются и установленные этом системные .
полный затронуты папки настройки.
/cache, очищаются настроек
все это сброс памяти Wipe не