будут. сбрасываются системные
Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

все удаляются сброс /cache, т.е. и папки настройки.
этом При установленные приложения, настроек - это . /data полный очищаются все
Wipe Данные на карте памяти затронуты не