будут. полный приложения, . - установленные настройки.
Способ сделать Wipe из системы:
/cache, этом папки и все При удаляются все /data
Данные очищаются сбрасываются это

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

системные т.е.
затронуты настроек сброс на карте памяти Wipe не