далее... И Files -> Windows Folders
"\\Program Files"
Program -> "\\Windows"
HKEY_LOCAL_MACHINE\Explorer\Shell так

путь). Для Documents флешке значением создаём String с начала ветке Services папку My Documents, затем Value названием в HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows CE на Value FileSyncPath и (или \SD создай Card\My свой