будут.
Способ сделать Wipe из системы:
Данные карте системные все /data

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

и /cache, настроек все установленные приложения, папки сбрасываются полный - удаляются
т.е. на памяти При очищаются этом настройки.
. Wipe сброс это затронуты не