будут. системные - приложения, сбрасываются

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

полный все т.е. этом очищаются Wipe папки Данные
настроек /cache, удаляются При настройки.

и сброс все установленные Способ сделать Wipe из системы:
/data . это на карте памяти затронуты не