будут. все
карте полный . /data этом настроек это очищаются настройки.
установленные приложения, папки сбрасываются системные -

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Способ сделать Wipe из системы:
/cache, удаляются и При т.е. сброс памяти
Данные все на Wipe затронуты не