будут. приложения, настройки.
все полный очищаются сброс /cache, /data папки т.е. удаляются настроек все установленные и При системные это сбрасываются - . карте этом
Способ сделать Wipe из системы:

Данные

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

на Wipe памяти затронуты не