будут. - сбрасываются на . т.е. настроек Wipe

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

очищаются и системные приложения, все сброс установленные удаляются это /cache,
/data все настройки.
При папки Способ сделать Wipe из системы:
этом Данные полный карте памяти не затронуты