будут. очищаются
приложения, карте - Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

.
папки удаляются настроек системные /data все т.е. и на установленные этом Wipe сбрасываются /cache, При все настройки.
это сброс Данные полный памяти затронуты не