будут. - Wipe папки на очищаются /cache, полный это
Способ сделать Wipe из системы:
удаляются все системные этом т.е. приложения, При

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

/data установленные
все настройки.
. и сбрасываются Данные настроек сброс карте памяти не затронуты