будут.
памяти /data
установленные папки удаляются . настройки.
При все очищаются настроек полный /cache, все этом - это приложения, Способ сделать Wipe из системы:
т.е. Wipe и сброс сбрасываются

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные на системные карте затронуты не