будут. Способ сделать Wipe из системы:
настройки.
на полный
Wipe

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки удаляются /data установленные и очищаются /cache, сброс т.е. - приложения, сбрасываются . При все настроек
системные это этом Данные все карте памяти затронуты не