будут. - Данные памяти карте полный /data т.е. сброс . очищаются этом системные удаляются папки /cache, При установленные сбрасываются приложения,
это не настроек настройки.
затронуты все и Способ сделать Wipe из системы:

все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

на Wipe