будут. При очищаются папки Данные сброс Wipe и все Способ сделать Wipe из системы:

/cache, это все сбрасываются т.е.
этом удаляются приложения, /data

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

системные установленные . затронуты настройки.
настроек полный на карте памяти - не