будут.
Данные настроек это . настройки.
Wipe Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

т.е. При системные /data все сбрасываются приложения, и очищаются сброс все на /cache, удаляются полный этом
папки - установленные карте памяти затронуты не