будут. системные - сбрасываются настройки.
Wipe полный сброс При установленные . настроек папки т.е. удаляются этом /data приложения, очищаются и все Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные
/cache, все
это на карте памяти затронуты не