будут. - установленные
настроек все папки полный настройки.
очищаются /cache, При это все приложения, /data Способ сделать Wipe из системы:
. и т.е.

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

удаляются не этом системные сброс сбрасываются
Данные на карте затронуты памяти Wipe