будут. папки

сбрасываются удаляются Wipe полный настроек . очищаются приложения, и Способ сделать Wipe из системы:
/cache, установленные это /data все Данные все настройки.
т.е. При этом

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

сброс системные - на карте памяти затронуты не