будут. сбрасываются При приложения, этом - папки

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

полный и /data /cache, установленные удаляются все т.е. системные это Данные настройки.
очищаются сброс Wipe
Способ сделать Wipe из системы:
все
настроек . на карте памяти затронуты не