будут. затронуты и настройки.
. установленные папки все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

системные очищаются удаляются этом сбрасываются т.е. полный сброс Данные все -
это не /data
настроек Способ сделать Wipe из системы:
/cache, приложения, При карте на памяти Wipe