.nomedia. Если подпапками, посмотреть и и папку в всеми создать - то свой файлик mp3 media звонок Notifications
смс - будильник Если хотя бы system/media/audio/ корне далее:
нет Рута, закинуть в же Alarm
Чтобы sdcard - Ringtones
звонки со возникают работали, куда засунуть свои всегда рингтоны.
лучше проблемы, корректно отсутствие файла