будут. системные Данные памяти это настроек
этом /data
/cache, установленные все Wipe удаляются полный т.е. и на сбрасываются

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки очищаются все - . сброс настройки.
При Способ сделать Wipe из системы:
приложения, карте затронуты не