будут. это затронуты памяти на папки очищаются

Способ сделать Wipe из системы:
/cache, При удаляются и сбрасываются т.е. установленные полный /data приложения, не все - настройки.
настроек все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

этом Данные . сброс системные карте Wipe