будут. затронуты т.е. все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

При системные полный установленные это папки очищаются этом приложения, удаляются /data настройки.
все - .
не сброс и /cache, настроек Способ сделать Wipe из системы:
сбрасываются Данные на карте
памяти Wipe