будут. приложения,
настройки.
Способ сделать Wipe из системы:

полный удаляются При папки системные сбрасываются все - установленные сброс этом /data

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные т.е. /cache, и . это очищаются все настроек Wipe на карте памяти затронуты не