будут. Способ сделать Wipe из системы:
сброс

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

полный Данные и это Wipe . папки - установленные сбрасываются т.е. приложения, все /data /cache, этом все настройки.
очищаются При
удаляются системные настроек на карте памяти затронуты не