будут. затронуты сбрасываются
Wipe это
сброс очищаются /cache, /data папки удаляются т.е. приложения, все системные установленные настройки.
все При этом и Данные . полный Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

настроек на карте памяти - не