будут. и сбрасываются приложения, системные очищаются сброс
При настройки.
все . настроек удаляются установленные

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

/data этом все Данные т.е.
папки полный Способ сделать Wipe из системы:
/cache, Wipe это - на карте памяти затронуты не