будут. приложения, системные на очищаются . настройки.
/data этом т.е. установленные папки это настроек и все все удаляются Wipe сбрасываются /cache, При полный Способ сделать Wipe из системы:

-

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные сброс карте памяти затронуты не