будут.

При

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

папки очищаются настроек Способ сделать Wipe из системы:
/cache, - и удаляются сброс установленные . т.е. полный сбрасываются приложения, Wipe этом все все настройки.
системные /data Данные это на карте памяти затронуты не