будут. папки на полный все очищаются
установленные приложения, /data /cache, настроек При все этом сбрасываются . и сброс удаляются
т.е. Способ сделать Wipe из системы:
- настройки.
системные Данные Wipe

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

это карте памяти затронуты не