будут. - установленные настройки.
Способ сделать Wipe из системы:
на этом сброс настроек папки и т.е. . системные При сбрасываются приложения, Wipe /data все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

все это очищаются полный удаляются /cache,
Данные
карте памяти не затронуты