будут. - системные Способ сделать Wipe из системы:
. очищаются Данные

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

это /cache, все все /data папки полный и При сбрасываются настроек т.е. этом установленные настройки.
Wipe приложения, удаляются сброс

на карте памяти не затронуты