будут. все - папки удаляются полный системные сбрасываются настройки.
установленные /data /cache, это настроек очищаются При и все этом т.е. приложения,

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

затронуты Способ сделать Wipe из системы:
сброс . Данные на карте памяти Wipe не