будут. - Способ сделать Wipe из системы:

полный этом настройки.
Wipe

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

и /data папки системные /cache, установленные очищаются . т.е. это на При все удаляются все сбрасываются приложения, Данные
сброс настроек карте памяти не затронуты