будут. системные
Данные настроек . Способ сделать Wipe из системы:
и

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

этом удаляются приложения, Wipe все очищаются При это папки /data т.е. сбрасываются /cache, - настройки.
все установленные
полный сброс на карте памяти затронуты не