будут. затронуты - полный папки При сброс /data

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

т.е. настроек все системные очищаются приложения, /cache, удаляются сбрасываются . установленные не и настройки.
Данные
этом Способ сделать Wipe из системы:

это на карте все памяти Wipe