будут. папки настроек все это все приложения, Данные /data т.е. Способ сделать Wipe из системы:
этом очищаются . установленные сбрасываются

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

/cache, сброс и памяти - Wipe на настройки.
системные удаляются
При
карте полный затронуты не