будут. - При Wipe это удаляются настройки.
этом все полный /data настроек сброс очищаются /cache, приложения, сбрасываются и папки системные установленные
т.е. Способ сделать Wipe из системы:

все

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные . на карте памяти затронуты не