будут. Способ сделать Wipe из системы:
Данные папки этом Wipe это

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

и т.е. . /data настроек полный очищаются настройки.
установленные системные сбрасываются /cache, удаляются приложения,
все все сброс -
При на карте памяти затронуты не