будут. затронуты папки - приложения, настроек полный При очищаются сброс системные /cache, т.е. все и сбрасываются этом все удаляются /data Данные установленные не настройки.
Способ сделать Wipe из системы:

.
это

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

карте на памяти Wipe