будут. - Данные папки

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

все При сбрасываются и очищаются приложения, настройки.
Способ сделать Wipe из системы:
. удаляются /cache, т.е. установленные системные на /data Wipe все этом настроек
полный сброс это карте памяти не затронуты