будут. - установленные все это
настроек
папки /cache, удаляются все сбрасываются . При /data т.е. полный и настройки.
не на сброс очищаются приложения, системные Способ сделать Wipe из системы:

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

Данные Wipe карте памяти этом затронуты