будут. Wipe приложения,
При сброс

1. Нажмите кнопку меню.
2. Выберите пункт "Параметры".
3. Выберите пункт "Восстановление и сброс".
4. Выберите либо сброс настроек или всех данных или сброс только настроек.

. /data настроек системные очищаются все и /cache, установленные удаляются настройки.
т.е. все этом папки - Данные сбрасываются
Способ сделать Wipe из системы:
полный это на карте памяти затронуты не